Die frühesten bekannten Einwohner des San Francisco Bucht-Bereichs waren die Ohlone Inder. Das Spanisch war zuerst bekannt hat erforscht die Region. Der englische Forscher Sir Francis Drake segelte entlang die kalifornische Küste 1579, aber betrat nicht San Francisco Bucht. 1776 stellten spanische Siedleren ein Fort im Bereich her und weihten die verbundene Mission Str. Francis von Assisi, San Francisco ein, von dem die Stadt es ist Name erhält.
Nach Unabhängigkeit von Spanien 1821, wurde der Bereich Teil von Mexiko. Es war nicht bis 1836, daß eine Stadt auf dem Rand der Bucht, außerhalb des Bereichs der Mission hergestellt wurde und Siedleren anfingen, zum Bereich angezogen zu werden. 1846 während des mexiko-amerikanischen Krieges, wurde die Stadt für die Vereinigten Staaten behauptet. Am 9. September 1850 wurde Kalifornien der 31. Zuwurde des Anschlußes.
San Francisco wuchs schnell resultierend aus den Goldanstürmen von 1848-49, wegen der Flut der Immigranten, die hoffen, sie anzuschlagen reich. Die Bevölkerung erhöhte sich von gerade 1000 Leuten 1848 bis 25000 Ende 1849. Es war der Terminus für das erste transkontinentale Gleis und überhaupt ermöglichte mehr Leuten, die Reise West zu bilden auf der Suche nach ihren Vermögenn. Während des zweiten Teils des 19. Jahrhunderts, kamen viele chinesische Immigranten, die Opium-Kriege in ihrem Heimatland fliehend, in Kalifornien an und stellten Gaststätten, Geschäfte und Wäschereien auf. Das erste der berühmten Drahtseilbahnen der Stadt wurde in Lehm-Straße 1873 angebracht.
1906 litt die Stadt unter einem strengen Erdbeben, geglaubt, um gemessene 7.8 auf der Richterskala zu haben. Gebrochenes Gas leitet die angezündeten und begonnenen großen Feuer, verursacht fast so viel Zerstörung wie die seismische Tätigkeit und läßt Swathes der Stadt in den Flammen für drei Tage. Mehr als 80% der Stadt wurde beschädigt, oder und bis zu einem Third von ihm ist Bewohner nach links Homeless zerstört. Das Umbauen der Stadt lag jedoch am bereiten Versorgungsmaterial der Immigrantarbeit schnelles.
San Francisco war nicht, wie streng beeinflußt durch den Börse-Abbruch 1929 und folgenden großen Tiefwurde in den dreißiger Jahren da viele andere amerikanische Städte. Keine der Banken der Stadt fielen aus und es war während dieser Periode, daß zwei von ihm größte Technikprojekte wurden aufgenommen ist; Aufbau der San Francisco-Oakland Bucht-Brücke und der Golden- Gatebrücke.
Während des Zweiten Weltkrieges wurde Fort-Maurer ein Haupteinschiffungpunkt für die Truppen, die für den Pazifik gesprungen wurden und die resultierende Zunahme von Jobs zeichnete mehr Leute zur Stadt, besonders afrikanische Amerikaner vom Süden. Viele dieser neuen Ankünfte entschieden, in Kalifornien nach dem Krieg zu bleiben.
In den sechziger Jahren wurde der Haight-Ashbury Bezirk ein Magnet für Intellektuelle, Radikale und Hippies. Die siebziger Jahre sahen den Aufstieg der Homosexuell-Rechtbewegung und der Kreation eines „homosexuellen Dorfs“ im Castro Bezirk der Stadt.